El proyecto se ha desarrollado en tres fases:

En el año 1999 se inició el diseño de la propuesta pedagógica, se elaboraron los primeros materiales y comenzaron las clases piloto en dos aulas experimentales.

Durante el año 2000, ser inició el diseño del Sistema de Formación "on-line" y se equipó un tercer aula piloto en el Centro de Educación Especial, Mª Corredentora de Madrid.

En el año 2001 se siguió avanzando en el desarrollo de los materiales, se diseñó el curso "on-line" dirigido a la Formación de Formadores.

En el curso 2001-2002, cursaron el Programa 144 alumnos repartidos en tres aulas.

En el periodo que va del 1 de junio de 2002 hasta el 1 de junio de 2004, se puso en marcha la divulgación del Proyecto y la nueva pedagogía a los centros de alumnos con n.e.e. de toda España. Al mismo tiempo, los profesores interesados pudieron realizar el curso de formación "on-line".

En esta segunda etapa del portal se ampliaron las ofertas. Los alumnos visitaron el portal desde sus casas y los formadores que imparten la metodología BIT han contado sus experiencias y enriquecido así el Proyecto.

Durante esta segunda fase un total de 48 alumnos asistieron al aula BIT, lo que permitió seguir avanzado en la investigación y desarrollar nuevos espacios en el portal.

Por último, al comienzo del curso 2003-2004, se firmó un convenio con la Obra Social de Caja Madrid a través del cual se subvencionan las clases del Proyecto BIT, en un aula cedida por La Casa Encendida, a un total de 24 alumnos.

La tercer fase del Proyecto BIT, se centra principalmente en el desarrollo de una sección para familiares de personas con síndrome de Down y/o discapacidad intelectual. De esta manera, se ofrece a todas estas personas un espacio específico para ellas, en el que puedan acceder a toda la información referente a la educación de sus hijos con las nuevas tecnologías.

En esta fase se ha ampliado el Sistema de Formación BIT con la creación de nuevos materiales tanto para el profesor como para el alumno; así han sido ampliadas principalmente las actividades de desarrollo cognitivo y el temario de cada programación.

Está previsto que sean publicadas las conclusiones de la primera parte de la investigación del Proyecto, así como el desarrollo de la segunda parte de la misma.

Por último, el Proyecto BIT continúa con su actividad docente en las aulas existentes en la actualidad: en el AULA AUNA siguen sus clases un total de 48 alumnos, 25 de los cuales está previsto que se gradúen al término de esta tercera fase; en el aula de La Casa Encendida, continúan las clases un total de 24 alumnos, los cuales han finalizado el Proyecto en años anteriores.